일각에서는 국정원이 선관위 보안점검 결과를 과도하게 위험한 것처럼 발표하면서 정쟁을 자초했다는 지적도 제기된다.
보안점검 발표 시점과 발표내용을 놓고도 논란이 이어지고 있다.
앞서 국정원, 선관위, KISA 등 3개 기관은 지난 7월부터 3개월간 합동으로 선관위 보안 시스템을 점검했으며, 국정원은 서울 강서구청장 보궐선거 하루 전날인 지난 10일 '선관위 투·개표 시스템이 해킹 가능하다'는 내용의 점검 결과를 발표한 바 있다.
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